مشکل بزرگی برای جادوگر معروف هری پاتر پیش آمده است: لرد ولدمورت دوباره آزاد شده و هاگوارتز را به وحشت انداخته است. هری مشغول کارهای مهم جادویی است، بنابراین بازی "Harry Potter in Trouble" برای کمک به شهر، که مقر مدرسه جادویی محبوب اوست، شخصیتهای مهم و قدرتمند دیگری را فراخوانده است. آنها کسی نیستند جز رئیس جمهور ایالات متحده آمریکا، باراک اوباما. با این حال، کارهای واقعاً دشواری در انتظار اوست. در طول این ماجراجویی، او باید تعداد زیادی از مصنوعات را پیدا کند که باید به کار گرفته شوند. رئیس جمهور آمریکا حتی باید یاد بگیرد که چگونه از چوب جادو استفاده کند تا بتواند برخی از جادوهای اساسی را انجام دهد که در طول بازی به کارش خواهند آمد.